Die Neue Schubert-Ausgabe ist nach Gattungen gegliedert und innerhalb der Gattungen in der Regel chronologisch geordnet.
Die Noten- und Dokumentenbände der Neuen Schubert-Ausgabe erscheinen im Bärenreiter-Verlag, Kassel. Die Kritischen Berichte werden separat im Verlag der Internationalen Schubert-Gesellschaft e. V. veröffentlicht.
Zusammen mit den ersten Bänden wurden die Editionsrichtlinien der Neuen Schubert-Ausgabe erarbeitet. Sie liegen heute in einer aktualisierten 7. Fassung (Tübingen 2022) vor.